Sus raíces coloniales se encuentran en la fundación en 1551 de la Facultad de Artes de la Real y Pontificia Universidad de México, la primera universidad fundada en el antiguo virreinato de la Nueva España. Sus orígenes modernos se hallan en la Escuela Nacional de Altos Estudios, fundada en 1910. Durante el porfiriato, y con el impulso de Justo Sierra, se promulgó la ley que reabrío la universidad y que la constituyó como nacional. En ese momento la Escuela estaba formada por tres áreas: humanidades, ciencias exactas y ciencias sociales y jurídicas. En 1924, mediante un decreto presidencial que le dio el actual nombre, se llevó a cabo la transformación de un área en la Escuela Nacional de Altos Estudios a la Facultad de Filosofía y Letras. A lo largo de su historia, que transcurrió en el edificio de Mascarones (desde 1938) hasta que en 1954, tras 26 años de planeación y construcción, pasó al sitio que hoy ocupa en la Ciudad Universitaria, en la Facultad de Filosofía y Letras.

En nuestra Facultad, han concurrido diversos saberes y se definieron campos disciplinarios que luego adquirieron su propio estatuto académico. Dada la especialización disciplinaria, diversas carreras se fortalecieron independientemente y se trasladaron en su momento a las Facultades de Ciencias, Ciencias Políticas y la de Psicología. Además, en nuestra dependencia se gestaron los institutos de investigaciones Históricas, Estéticas, Filológicas, y Filosóficas, así como el de Geografía, entre varios más de nuestra Universidad. Los miembros de estas dependencias, en una proporción considerable, son egresados de las aulas de la Facultad de Filosofía y Letras y que, tradicionalmente, han sido profesores de la misma. Actualmente, y con la inauguración en 2011 del nuevo edificio de la Facultad que lleva por nombre “Adolfo Sánchez Vázquez”, se mantiene la tendencia histórica al fortalecimiento de las humanidades en la Universidad Nacional Autónoma de México.

La Escuela Nacional de Estudios Superiores, forma parte del UNAM Campus Morelia. La UNAM es la universidad pública y gratuita más grande de Latinoamérica. Tiene la misión de formar de manera integral y multidisciplinaria profesionales y técnicos, docentes e investigadores de alta calidad académica y sólido compromiso social, que contribuyan a la solución de problemas y a la construcción de una sociedad más justa, con mayor equidad y respeto entre los seres humanos, y entre éstos y la naturaleza.
Actualmente la ENES Unidad Morelia cuenta con trece programas de licenciaturas y seis programas de posgrado. Además ofrece programas de Educación Continua, cursos en el Centro de Idiomas (CIEM) y múltiples actividades artísticas y culturales en el UNAM Centro Cultural Morelia. La infraestructura de la ENES esta conformada por edificios de docencia e investigación, aulas magnas, talleres de arte y diseño, biblioteca, laboratorios de prácticas e investigación en el área de las ciencias y las humanidades, centro de idiomas, centro de cómputo, canchas deportivas, foro al aire libre, librería y cafeterías.

El Instituto de Investigaciones Antropológicas (IIA) es un instituto de investigación humanística de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) dedicado a la docencia, difusión e investigación original en antropología, adscrito al Subsistema de Humanidades de la Coordinación de Humanidades de la UNAM. Su sede actual se ubica en el Circuito Exterior de la Ciudad Universitaria de la UNAM. El IIA fue fundado el 4 de octubre de 1973, a instancias de la antigua Sección de Antropología (1963-1973) del Instituto de Investigaciones Históricas de la UNAM. Entre 1998 y 2015 contó con una sede externa en San Cristóbal de Las Casas, Chiapas, donde se ubicó el Programa de Investigaciones Multidisciplinarias sobre Mesoamérica y el Sureste (PROIMMSE). En 2015 el Consejo Técnico de la UNAM aprobó su constitución como un centro de investigación directamente dependiente de la Coordinación de Humanidades de la UNAM y pasó a denominarse Centro de Investigaciones Multidisciplinarias sobre Chiapas y la Frontera Sur (CIMSUR).

El Instituto de Investigaciones Sociales (IIS) es un instituto de investigación en ciencias sociales de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). La sede del IIS se encuentra en la Ciudad Universitaria de la UNAM y su director actual es Miguel Armando López Leyva. La fundación del IIS ocurrió el 11 de abril de 1930, bajo el rectorado de Ignacio García Téllez, lo que lo convierte en el instituto de investigación más antiguo de la Coordinación de Humanidades de la UNAM. Actualmente lleva a cabo trabajos en siete áreas principales de investigación: actores y procesos sociales, estudios agrarios, estudios de la educación y la ciencia, estudios urbanos y regionales, instituciones políticas, población y estudios demográficos y sociedad y cultura. En el plano de la docencia, el IIS participa junto con otras entidades universitarias en cinco programas de posgrado de la UNAM: el Posgrado en Antropología, el Posgrado en Ciencias de la Administración, el Posgrado en Ciencias de la Sostenibilidad, el Posgrado en Ciencias Políticas y Sociales, y el Posgrado en Urbanismo. Desde 1939, el IIS edita la Revista Mexicana de Sociología, una de las revistas de ciencias sociales más antiguas de México y América Latina.

El Centro de Investigaciones Multidisciplinarias sobre Chiapas y la Frontera Sur (CIMSUR) es un centro de investigación en ciencias sociales y humanidades de la Coordinación de Humanidades de la Universidad Nacional Autónoma de México. Su sede se encuentra en la ciudad de San Cristóbal de Las Casas. El primer antecedente del CIMSUR se encuentra en el Centro de Investigaciones Humanísticas de Mesoamérica y el Estado de Chiapas (CIHMECH), una asociación civil fundada en San Cristóbal de Las Casas bajo convenio de la UNAM y cuatro organismos del estado de Chiapas en 1985. En 1991, la UNAM incorporó administrativamente al CIHMECH, dotándolo de personal y presupuestos propios. El 26 de mayo de 1998 el CIHMECH se reestructuró como el Programa de Investigaciones Multidisciplinarias sobre Mesoamérica y el Sureste (PROIMMSE) de la UNAM, por acuerdo del entonces rector Francisco Barnés de Castro, y se incorporó al Instituto de Investigaciones Antropológicas (IIA) de la UNAM. En 2015 y bajo propuesta del IIA, el Consejo Universitario aprobó la creación del Centro de Investigaciones Multidisciplinarias sobre Chiapas y la Frontera Sur (CIMSUR) a partir del PROIMMSEE y pasó a adscribirse directamente a la Coordinación de Humanidades de la UNAM.